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Los científicos del EMBL de Heidelberg (Laboratorio Europeo de Biología Molecular) han creado un nuevo software que es capaz de comprender rápidamente lo que los investigadores están buscando, realiza  automáticamente complejos experimentos de microscopía. El trabajo se publica en la revista científica “Nature Methods”.

La vista de un investigador sentado en un microscopio durante horas, buscando minuciosamente las células correctas, puede ser pronto una cosa del pasado, gracias al nuevo software creado por científicos del European Molecular Biology Laboratory (EMBL) en Heidelberg, Alemania (Laboratorio Europeo de Biología Molecular). Presentado en Nature Methods, el nuevo programa es capaz de “aprender” de forma ràpida lo que el científico está buscando para después hacerse cargo de esa tarea laboriosa que probablemente requiere mucho tiempo. Automáticamente realiza complejos experimentos de microscopía para detectar células con características interesantes.

Llamado Micropilot, el software acerca el proceso del aprendizaje a la microscopía. Se analizan las imágenes de baja resolución tomadas por un microscopio y una vez que se ha identificado una célula o estructura en la que los científicos están interesados, automáticamente es el microscopio el que inicia el experimento. Esto puede ser tan simple como la grabación de alta resolución de vídeos time-lapse o tan complejo como el uso de rayos láser que interfieran con las proteínas fluorescentes marcadas para después grabar los resultados.

El software supone una gran ayuda para los estudios de la “System Biology” (Biología de Sistemas), ya que genera más datos y es más rápido. En tan sólo cuatro noches de trabajo, Micropilot detectó 232 células en dos etapas concretas de la división celular, realizándose un experimento de imágenes complejas en ellas. Un equipo experimentado tendría que trabajar a tiempo completo durante al menos un mes para encontrar esas células de entre los muchos miles de la muestra. Con un rendimiento tan alto, Micropilot puede  generar datos suficientes de una forma fácil y rápida, resultados que son estadísticamente fiables, permitiendo a los científicos investigar el papel de cientos de proteínas diferentes involucradas en un proceso biológico.

Jan Ellenberg y Pepperkok Rainer que junto a sus equipos diseñaron Micropilot en el EMBL , han utilizado el software para implementar varios experimentos diferentes de microscopía, investigando diversos aspectos de la división celular, determinando estructuras conocidas como el retículo endoplásmico, descubriendo el papel de dos proteínas, CBX1 y CENP-E en la condensación de material genético en los cromosomas y en la formación del huso que ayuda a alinear los cromosomas. Este software será una herramienta clave para los proyectos europeos relacionados con  los procesos relacionados con el “System Biology” (Biología de Sistemas), como los denominados Mitosys y SystemsMicroscopy, para los cuales Ellenberg y Pepperkok están desarrollando la tecnología adecuada.

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